我的房屋被区政府违法拆除了，我的合法房屋及相应财产都造成了很大损失，通过我向法院起诉，已经确认了区政府的违法事实，但是我的损失一直没有得到相应的赔偿，我应该怎么办？

既然是你们市的区政府对你的合法房屋采取行政侵权行为，也经过了法院的确认。
根据《中华人民共和国国家赔偿法》第二条和第四条的规定，国家机关和国家机关工作人员违法行使职权侵犯公民、法人、其他组织合法权益并造成损害的，被侵权人有取得赔偿的权利。具体的赔偿由赔偿义务机关承担相应的赔偿义务，而你的情况具体的赔偿义务机关应该是你们市的区政府，你应该在法定期限内向赔偿义务机关也就是区政府提出赔偿申请。